কবি কাজী নজরুল ইসলাম বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রথম উপাচার্য প্রফেসর ড. এম শামসুর রহমান রবিবার বিকাল ৫টায় রাজধানীর এ্যাপোলো হাসপাতালে হৃদযন্ত্রের ক্রিয়া বন্ধ হয়ে শেষ নিঃশ্বাস ত্যাগ করেন (ইন্নালিল্লাহি... রাজিউন)। মৃত্যুকালে তার বয়স হয়েছিল ৮০ বছর। জাতীয় কবি কাজী নজরুল ইসলাম বিশ্ববিদ্যালয়ের বর্তমান উপাচার্য প্রফেসর  ড. এ এইচ এম মোস্তাফিজুর রহমান, ট্রেজারার প্রফেসর মো. জালাল উদ্দিন, ডিন, বিভাগীয় প্রধান, রেজিস্ট্রার, শিক্ষক, কর্মকর্তা, কর্মচারী এবং শিক্ষার্থীবৃন্দ তাঁর বিদেহী আত্মার প্রতি গভীর শোক প্রকাশ করেন এবং শোক সন্তপ্ত পরিবারের প্রতি গভীর সমবেদনা জ্ঞাপন করেন। প্রফেসর ড. এম শামসুর রহমান জাতীয় কবি কাজী নজরুল ইসলাম বিশ্ববিদ্যালয়ে গত ২৪শে জুলাই ২০০৪ হতে ৬ই জুন ২০০৬ তারিখ পর্যন্ত প্রকল্প পরিচালক এবং ৭ই জুন ২০০৬ হতে ১৯শে এপ্রিল ২০০৯ তারিখ পর্যন্ত উপাচার্য হিসেবে দায়িত্ব পালন করেন। মৃত্যুকালে তিনি স্ত্রী এবং তাঁর এক ছেলে ও এক মেয়ে রেখে গেছেন।